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所谓许可证管理是指对外贸易经营者进口或者出口国家规定限制进出口的货物和技术，必须事先得到国家的许可，取得进口或者出口许可证，作为海关对进出境货物或者技术查验、放行的凭证。进出口许可证制度是世界各国普遍实行的管理对外贸易活动的重要措施之一，它在维护正常的贸易经营秩序、收集有关的贸易统计资料、保护国内资源和市场、维护国家经济利益和经济安全等方面发挥着重要作用。随着我国对外贸易规模的不断扩大，贸易摩擦加剧，过去不被重视的许可证预警功能日渐凸显。无论是数量限制，还是反倾销、反补贴和保障措施的出台，都需要许可证制度的积极配合。
在实施许可证管理的目的上，我国经历了一个逐步明确和完善的过程。加人世界贸易组织前，我国实施许可证制度的主要目的是保护国内特定的工业、维护国际收支平衡，控制进口贸易总量以平衡进出口贸易、防止不必要的货物进口等。目前，我国许可证管理的主要目的是从宏观管理出发，维护国民经济安全、健康和可持续发展。
第一，保护国内资源安全。根据世界贸易组织的规则、其他国家的做法和我国对外贸易法的规定，实施进口许可证的目的是为了反对不正当竞争、保护国内幼稚工业、保护国内短缺供应、贯彻卫生管理条例、保护野生动物、管理关税配额、保护公共利益、保护消费者的健康和国家安全等。实施出口许可措施的目的是保护国家安全、保护濒临枯竭的自然资源、配合政府的外交政策、在商品出现短缺时提供保护等。目前，我国实施出口许可证管理的商品大多是煤炭、焦炭、钨、锑、锌、锡等不可再生的大宗资源性商品，国内供应短缺或需要有效保护的可能用竭的资源性产品，如木材等，还有粮食、甘草、锯材和重水等关系国计民生或生态环境的商品，以及对国内稀缺或濒危的动植物资源的保护。对这些资源性产品实施出口许可证管理，确保了国家重要战略资源的有效保护和合理利用有效遏制了生产和出口的无序状态，实现了资源利用和出口增长的协调发展，达到了统筹国内外资源性产品的目的。
第二，保护产业安全。我国是一个发展中的大国，市场经济发育不成熟悉，我国主要产业的市场开放步伐加快，面临的外部环境更加复杂，工业体系尚未健全，某些产业依然幼稚且耗能高。如通过对一些重点、敏感商品实施世界贸易组织规则允许的自动进口许可证措施，防止某些商品的过量进口和集中进口，对减轻国外强势产业对国内相关产业的冲击可以起到一定的保护做用，保证我国对外贸易的可持续发展和国内产业的安全。
第三、维护市场经营秩序。正常的市场秩序要有一定的市场容量保证，为维护市场容量，各国或地区均采用必要的措施进行调整。出口秩序混乱，低价竞销一直是制约我国出口的重要问题，也因此招致很多国外的反倾销制裁，为维护良好的竞争有序的出口秩序，国家可以限制出口。如调控棉花、粮食等大宗产品，既可以满足国内需求，又不会导致国际市场价格上扬。许可证作为一种可行的非关税管理手段，可以规范出口秩序、提高出口效益，可以避免抬价收购、争相出口、扰乱出口市场秩序的现象，可以避免低价出口招致国外反倾销诉讼。根据国际惯例，出口国可通过许可证手段管制常规武器和双用途物品及相关技术出口，严格限制核材料、核设备和反应堆材料及相关技术出口，严格控制生物、化学武器、导弹及其技术的出口。对于重要的战略物资和敏感商品，以及可能引起社会问题、国际纠纷或带有不安定因素的商品的进出口，许可证可以起到必要的监控与管制作用，如对抑制毒化学品、监控化学品、敏感电子设备等。对有悖外交政策的进出口贸易，或有违社会公共道德等商品的进出口，国家应通过许可证严格控制，如对联合国采取贸易制裁的国家和地区的进出口贸易，对烟、烈酒等商品的进口。
第四，发挥统计、监督和预警功能。通过许可证手段收集受监控商品进出口动态。