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再生资源企业缺少进项，税负高，是个普遍存在的问题。再生资源回收企业的原料来源，一是从众多的消费者、流动商贩、个体户手中购买再生资源，这种回收方式约占国内回收的85%，这些回收者不能开具增值税发票，回收企业无法抵扣进项税。二是从产废企业购买再生资源，但产废企业销售再生资源时往往不按规定对外开具增值税专用发票，导致回收企业无法抵扣进项税。
再生资源行业的增值税税率是13%，加之再生资源回收企业无法取得增值税进项抵扣，需承担高达15%乃至更高的税负(除增值税以外，还包括一些地方附加税)。因此，再生资源行业急需要税收优惠政策，以促进再生资源行业的发展，减少税收压力。
再生资源行业面临的问题是因为其没有进项，各地税收洼地对于这种没有进项的企业都会拒之门外，哪怕它可以为当地带来税收。这就造成了再生资源行业税负重，最为关键的是因为它在注册经营地能开出的票也是有限制的，最终就导致再生资源行业发展受到限制。
很多园区不接受再生资源行业主要还是因为需要的票量大但是所缴纳的税少。这就造成了再生资源不能享受到税收洼地的税收优惠政策，不能节税。
但是目前一些地方为了招商引资，做大地方财政。对再生资源行业有核定优惠政策。如有些开发区规定区内再生资源类注册公司，将企业销售结算业务放在新公司，新公司缴纳的每一笔税金增值税税金均可享受高达90%的税收返还政策，企业所得税核定1%。
最后，提醒再生资源企业，地方给了优惠政策，也一定要遵守税法、不违反税法，企业依法依规纳税，合法享受政策。千万不要走虚开发票这条路。千万不要，否则后果很严重。最近国内出了不少这方面问题。